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导 读
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA) 是院内和社区感染的主要致病菌之一。MRSA耐药基因mecA编码青霉素结合蛋白PBP2，与β-内酰胺类抗生素亲和力较低导致该类抗生素作用失效，而甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌 (MSSA) 则不携带mecA基因。携带mecA基因的葡萄球菌盒染色体 (SCCmec) 水平基因转移是新发金黄色葡萄球菌耐甲氧西林的重要因素，但研究人员很少实时监测到耐药基因mecA的转移。而本文基于NGS技术溯源监测到耐药基因mecA转移至MSSA菌株中，帮助探查医院感染暴发原因。
Tips
案例描述
荷兰某医院肿瘤科入院5周的患者出现MRSA导致的菌血症。接触史追踪检测显示其中2例患者和1名医务工作者均出现耐夫西地酸MRSA感染。临床对医务工作者进行4个周期的MRSA有效去定植治疗，2位病患1位综合身体情况未做去定植治疗，另外1位自发失去MRSA定植能力。
证据 1
耐夫西地酸的MRSA菌株在当地医院非常罕见，而早在入职筛查时，感染的医务工作者检出耐夫西地酸MSSA；
证据 2
感染暴发之后医务工作者的丈夫检出也检出该罕见耐药MRSA菌株，但鼻拭子样本中分离MSSA。
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也就是说，医务工作者早些时候筛查携带MSSA菌株，感染暴发期间检出MRSA菌株，而她的丈夫检出两种菌株共存，可能因为耐药菌株将耐药基因mecA转移至敏感菌株，最终该医务工作者携带了耐夫西地酸的MRSA菌株；鉴于夫西地酸耐药MRSA菌株在当地罕见，医务工作者与两位感染患者有接触史，医生推测其它两位感染患者的耐夫西地酸MRSA菌株可能源于该医务工作者携带的MRSA菌株。
临床医生基于以上2点证据提出假说：最初携带耐夫西地酸MSSA菌株的医务工作者获得了水平转移的mecA耐药基因而成为MRSA菌株，进而传染至其它2位患者，导致肿瘤科感染暴发。
检测结果
01
MLVA (多位点可变数目串联重复序列)分型鉴定所有菌株均为MT4053-MC0005；
02
基于NGS测序数据，多位点序列分型 (MLST) 进行序列分型，显示58株分离菌株均属于克隆群5，其中37株属于克隆群5中的ST5型；
03
全基因组MLST (wgMLST) 和单核苷酸多态性 (SNP) 分析结果表明医务工作者分离菌株与感染患者、同事和家属分离菌株关系密切。
Fig1. 分离的MASA和MSSA菌株分子流行病学分析结果
Fig2. 基于NGS技术绘制分离的58株菌株最小生成树
NGS技术验证感染暴发假说
联合MLVA分型与基于NGS的wgMLST、SNP技术，本研究综合从分子流行病学方面证实了耐夫西地酸MSSA菌株获得了水平转移的耐药基因mecA导致肿瘤科感染暴发的假说，描述了医务工作者可以作为感染源导致感染大暴发。研究者提倡对暴露接触MRSA检测阳性患者的医务工作者要及时提倡医务工作者进行MRSA携带筛查，预防感染暴发。
参考文献：
Weterings, V., Bosch, T.,et al. (2017). Next-Generation Sequence Analysis Reveals Transfer of Methicillin Resistance to a Methicillin-Susceptible Staphylococcus aureus Strain That Subsequently Caused a Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Outbreak: a Descriptive Study. Journal of Clinical Microbiology, 55(9), 2808-2816. DOI: 10.1128/JCM.00459-17
本文由华大医学Micro-NGS感染频道提供
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中国·上海 2017年10月21日-22日
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